Elaphocordyceps f, Элафокордицепс. От έλαφος (elaphos) m f, олень + Cordyceps f, Кордицепс (название рода)
Elaphomyces m, Элафомицес. От έλαφος (elaphos) m f, олень + μύκης, ητος (mycēs, ētos) m, гриб
Encoelia f, Энцелия. От εν- (en-), приставка со значением неполноты качества + κοίλος (koilos), впалый, выдобленный, пустой.
Endoptychum n, Эндоптихум. От ένδον (endon), внутри, дома, в отечестве + πτύξ πτυχός f (ptyx, ptychos), складка, слой, ряд (например, сложенные вместе дощечки, кожи и пр.)
Enteridium n, Энтеридиум. От εντερον n (enteron) обычно мн.ч., внутренности, кишки [Saccardo R.A., Sylloge Fungorum II: 409 (1888)]
Entoloma n, Энтолома. От εντός (entos), внутрь + λομα, τος (loma, tos) n, бахромчатый край [Saccardo R.A., Sylloge Fungorum V: 679 (1887)]
Eocronartium n, Эокронарциум. От χρὼννυμι (chrōnnymi), красить + άρτιος (artios), стройный, совершенный [Saccardo, P.A. Sylloge Fungorum VII: 597 (1888)]
Epichloe f, Эпихлоэ. От επι (epi), на, у, при + χλόη (chloē) f, зелень.
Erastia f, Эрастия. В честь Эраста Пармасто (Erast Parmasto, 1928- , эстонский миколог)
Erysiphe f, Эрисифе. От ερυσίβη (erysiphe) f, ржавчина [Saccardo, P.A. Sylloge Fungorum I: 15 (1882)]
Exidia f, Эксидия. От exsudo, avi, atum, are, выходить наружу, выделяться [Saccardo R.A., Sylloge Fungorum VI: 772 (1888)]
Exobasidium n, Экзобазидиум. От εξ (ex), вне, вдали от + basidium, i n, базидий. Также βάσις, εος (basis, eos) f, основание, пьедестал.